Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CttnQ60598 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CttnQ60598 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms