Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc5a6Q5U4D8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc5a6Q5U4D8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms