Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sfmbt2Q5DTW2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfmbt2Q5DTW2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms