Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC93Q567U6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms