Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc84Q4VA36 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms