Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa20Q45VN2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defa20Q45VN2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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