Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fchsd2Q3USJ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fchsd2Q3USJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms