Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D13Ertd608eQ3UPR8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D13Ertd608eQ3UPR8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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