Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf5Q3UK78 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcgf5Q3UK78 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms