Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cops9Q3U898 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cops9Q3U898 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms