Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q3U595 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q3U595 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q3U595 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q3U595 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q3U595 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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