Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LcorlQ3U285 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms