Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc102aQ3TMW1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms