Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDSNQ15517 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDSNQ15517 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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