Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrriq3Q14DL3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms