Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itgb8Q0VBD0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itgb8Q0VBD0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms