Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps8Q0P5W1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms