Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms