Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sox8Q04886 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sox8Q04886 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms