Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RelaQ04207 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms