Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ascl1Q02067 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ascl1Q02067 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms