Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd1Q01822 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms