Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gabpb1Q00420 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb1Q00420 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms