Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Stx2Q00262 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx2Q00262 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms