Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabpb2P81069 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms