Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Irx2P81066 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Irx2P81066 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms