Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad1P70340 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms