Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vsnl1P62761 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms