Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms