Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphp4P59240 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphp4P59240 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms