Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klf16P58334 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Klf16P58334 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Klf16P58334 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Klf16P58334 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf16P58334 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Klf16P58334 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Klf16P58334 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klf16P58334 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf16P58334 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klf16P58334 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms