Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atp5eP56382 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atp5eP56382 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms