Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab4aP56371 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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