Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Faf1P54731 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Faf1P54731 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms