Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.14
SMARCA4P51532 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms