Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa-rs12P50716 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms