Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hcls1P49710 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms