Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox2P48432 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sox2P48432 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms