Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VdrP48281 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VdrP48281 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms