Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Epb41P48193 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Epb41P48193 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epb41P48193 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms