Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl13P47963 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms