Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
InaP46660 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
InaP46660 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
InaP46660 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
InaP46660 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
InaP46660 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InaP46660 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InaP46660 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
InaP46660 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
InaP46660 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
InaP46660 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
InaP46660 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms