Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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