Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VhlP40338 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VhlP40338 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VhlP40338 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VhlP40338 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
VhlP40338 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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