Protein–RNA interactions for Protein: P37242

Thrb, Thyroid hormone receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThrbP37242 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ThrbP37242 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ThrbP37242 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ThrbP37242 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ThrbP37242 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms