Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc10P31257 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms