Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms