Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VtnP29788 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VtnP29788 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VtnP29788 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VtnP29788 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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