Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprmP28828 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprmP28828 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprmP28828 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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