Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BrafP28028 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BrafP28028 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BrafP28028 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BrafP28028 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BrafP28028 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms